Kit ADN environnemental : Détection et suivi de populations d’écrevisses
Kit ADNe – Qui a envahi la rivière ?
Comment diagnostiquer la présence d'espèces aquatiques rares ou invasives sans perturber leur habitat naturel ? Le Kit ADN environnemental Jeulin offre une réponse concrète et innovante à cette problématique scientifique contemporaine. Conçu à partir des protocoles de biosurveillance de l'OFB, ce kit pédagogique permet d'initier les élèves à la technique de l'ADNe (ADN environnemental).
À travers une mise en situation concrète, vos élèves analysent des prélèvements d'eau simulés sur trois sites distincts d'un cours d'eau. Grâce à l'électrophorèse sur gel d'agarose, ils séparent les amplicons issus d'une PCR multiplex ciblant le gène mitochondrial 16S. En comparant les bandes obtenues à l'échelle de poids moléculaire et au témoin positif, ils identifient sans ambiguïté quatre espèces d'écrevisses (l'espèce autochtone protégée et trois espèces exotiques envahissantes).
Outre la maîtrise technique du pipetage et du dépôt en puits, ce TP stimule l'esprit critique et l'analyse de données biologiques. Il illustre de façon saisissante la puissance du diagnostic moléculaire appliqué à la conservation de la biodiversité.
Format : 20 tests soit 80 dépôts à analyser + 10 dépôts (poids moléculaire)
Durée de l'expérience : 60 min (20 min de migration)
Conservation :
Avant utilisation = 12 mois à -20°C ou 1 mois à TA
Après utilisation = 12 mois à -20°C et 1 semaine à 4°C
Note : Nous préconisons de faire des aliquot de la quantité d'ADN nécessaire par TP par une technicien expérimenter dans des conditions les plus stériles possibles pour éviter le processus de congélation et décongélation et la contamination par des DNAse.
Séparation des fragments d’ADN : gel d'agarose à 2 %
Composition :
- 4 tubes d'ADN calibrés prêt à déposer
- 1 tube d'échelle poids moléculaire
- 1 notice technique et pédagogique (en ligne)
| Thématiques | ADN prêt à déposer, Adaptation à l'environnement, Environnement et Écologie |